腸道微生物研究解決方案

2017-04-08

人體內的腸道微生物至少存在1000種細菌,細胞數達到1014個,約占人體微生物量的80%。腸道微生物爲人類的代謝過程提供底物、酶和能量,有助于人體營養吸收和代謝作用,同時腸道微生物代謝産生的脂肪酸、膽汁酸、維生素、神經遞質等許多重要的代謝物,參與腸道平衡、免疫系統、內分泌調節和神經調節等許多重要的生理過程。菌群結構的改變與腸道炎症、糖尿病、肥胖症、腫瘤、抑郁症等諸多疾病的發生、發展有著重要聯系。

肠道微生态,16S,代谢组

16S 扩增子测序:肠道菌群的多样性研究。通过提取粪便或者内容物样品的DNA,扩增16S rDNA目标区域,通过检测目标区域的序列变异和丰度获得肠道微生物多样性及群落组成等信息。

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宏蛋白質組學:腸道菌群的功能研究。從蛋白質水平對特定環境下的整個微生物群落的所有蛋白質組成進行大規模分析,而獲得微生物的蛋白種類、表達水平、通路富集和注釋等信息。

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非靶代謝組學:腸道菌群代謝産物的大規模分析。從代謝水平考察腸道微生物在特定時間和條件下的代謝産物組成以及濃度變化。APT具有自主開發的代謝物標准品庫,超過2700種代謝物,覆蓋氨基酸、核酸、碳循環、有機酸、膽汁酸、維生素等多種腸道菌群-宿主相關代謝産物。標准品庫能提供可靠的代謝物鑒定保證。

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靶向代謝組學:特定類型的腸道菌群代謝産物進行特異性檢測。對感興趣的腸道微生物的代謝産物如短鏈脂肪酸、神經遞質進行質譜靶向分析檢測,所采用技術具有高度的靈敏度、准確性和特異性。

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多組學關聯分析:整合微生物组与代谢组,进行16S 扩增子测序+代謝組學关联分析,依靠生物信息分析技术,挖掘研究差异菌群与差异代谢物之间的相关性。 

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腸道微生物是生物醫學界的一大研究熱點,APTBIO整合基因組蛋白質組代謝組學多組學等多個平台,從基因水平、蛋白水平、代謝水平、生信分析等多個層次出發對腸道菌群的結構、功能、代謝産物進行研究,認識腸道菌群的代謝特征和生理功能,助力于腸道菌群-代謝物-宿主相互作用機制的深入挖掘。

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